Pandeminin başlangıcından bu yana tanı testleri, hastalığa neden olan SARS-CoV-2 virüsünün yayılmasını kontrol etmede hayati bir rol oynadı.COVID-19.Hızlı antijen testleriEvde veya klinik ortamda yapılan uygulamalar 15 dakika veya daha kısa sürede sonuç verir.Bir kişiye ne kadar erken teşhis konulursa o kadar erken tıbbi yardım alabilir ve kendilerini diğerlerinden izole edebilir.Ancak virüsün yeni varyantları ortaya çıktığında bu varyantlar bu testlerle tespit edilemeyebilir.
Hızlı antijen testlerinin çoğu SARS-CoV-2 nükleokapsid proteinini veya N-proteinini tespit etmek için tasarlanmıştır.Bu protein viral parçacıklarda ve enfekte kişilerde bol miktarda bulunur.Hızlı test kitiGenellikle N proteininin farklı kısımlarına bağlanan iki farklı tanısal antikor içerir.Bir antikor, bir numunedeki N proteinine bağlandığında, test kitinde bir enfeksiyonu gösteren renkli bir çizgi veya başka bir sinyal belirir.
Protein N, 419 amino asit yapısal biriminden oluşur.Bunlardan herhangi biri mutasyonla başka bir amino asitle değiştirilebilir.Ph.D. liderliğindeki araştırma grubu.Emory Üniversitesi'nden Philip Frank ve Eric Ortlund, bu tek amino asit değişikliğinin hızlı bir antijen testinin performansını nasıl etkilediğini araştırmak için yola çıktı.Virüsün N proteinindeki her mutasyonun tanısal bir antikora bağlanmayı nasıl etkilediğini eş zamanlı olarak değerlendirmek için derin mutasyon taraması adı verilen bir teknik kullandılar.Sonuçları 15 Eylül 2022'de Cell'de yayınlandı.
Araştırmacılar yaklaşık 8.000 N protein mutasyonundan oluşan kapsamlı bir kütüphane oluşturdular.Bu varyantlar tüm olası mutasyonların %99,5'inden fazlasını oluşturur.Daha sonra her bir varyantın, ticari olarak temin edilebilen 11 hızlı antijen testinde kullanılan 17 farklı tanısal antikorla nasıl etkileşime girdiğini değerlendirdiler.ev kitleri.
Ekip, hangi N-protein mutasyonlarının antikor tanımayı etkilediğini değerlendirdi.Bu bilgiye dayanarak her tanısal antikor için bir “kaçış mutasyon profili” oluşturdular.Bu profil, N proteininde antikorun hedefine bağlanma yeteneğini etkileyebilecek spesifik mutasyonları tanımlar.Analiz, günümüzün hızlı testlerinde kullanılan antikorların, SARS-CoV-2'nin endişe verici ve endişe verici tüm geçmiş ve mevcut varyantlarını tanıdığını ve bağladığını gösterdi.
Çeşitli tanısal antikorlar, N proteininin aynı bölgesini tanısa da, araştırmacılar her antikorun benzersiz bir kaçış mutasyonu imzasına sahip olduğunu buldu.SARS-CoV-2 virüsü mutasyona uğramaya ve yeni varyantlar üretmeye devam ettikçe bu veriler, yeniden değerlendirilmesi gerekebilecek test kiti antikorlarını işaretlemek için kullanılabilir.
Ortlund, "Enfekte bireylerin doğru ve etkili bir şekilde tanımlanması, COVID-19'un hafifletilmesi için kritik bir strateji olmaya devam ediyor ve çalışmamız, tespite müdahale edebilecek gelecekteki SARS-CoV-2 mutasyonları hakkında bilgi sağlıyor" dedi."Burada özetlenen sonuçlar, yeni varyantlar ortaya çıkmaya devam ettikçe bu virüse hızla uyum sağlamamıza olanak tanıyor ve acil klinik ve halk sağlığı etkileri sunuyor."
Arka Plan: Mutasyon Derin Taraması, şu anda mevcut hızlı antijen testlerini kullanarak SARS-CoV-2 nükleokapsidindeki kaçış mutasyonlarını tespit eder.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA hücresi.2022 Eylül 15;185(19):3603-3616.e13.İçişleri Bakanlığı: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 Ağustos 2022 PMID: 36084631.
Finansman: Ulusal Biyomedikal Görüntüleme ve Biyomühendislik Enstitüsü NIH (NIBIB), Ulusal Diyabet, Sindirim ve Böbrek Hastalıkları Enstitüsü (NIDDK) ve Ulusal Alerji ve Enfeksiyon Hastalıkları Enstitüsü (NIAID), Amerikan Kalp Derneği.
NIH Research Matters, NIH uzmanları tarafından incelenen önemli NIH araştırma bulgularının haftalık bir güncellemesidir.Ulusal Sağlık Enstitüleri Direktörü İletişim ve Halkla İlişkiler Ofisi tarafından yayınlanmaktadır.